故事发生在前作《伊丽莎白》的十五年后，此时的英国女王伊丽莎白一世(凯特·布兰切特饰)已经被政敌的无数次阴谋暗算历练得更加强大，她已经不再把国内的阴谋家们放在眼里，因为在她身边依然有那个忠诚无二的皇家重臣弗朗西斯·沃辛汉爵士(杰弗瑞·拉什饰)守护者。