金刚狼3结局是x教授和狼叔全死了，老一辈变种人全部死亡，新一代变种人出现。

该片根据漫威漫画改编，该片故事背景设定在2029年，讲述了迈入暮年的金刚狼渐渐失去了体内的自愈因子，当一个与他能力相似的变种人劳拉出现，金刚狼决定出山保护劳拉的故事。

变种人大幅减少，X战警已经解散。身心疲惫的暮狼罗根自愈因子逐渐消失，整天饮酒度日，并靠当司机生活，他在墨西哥边境隐居照顾着饱受病痛折磨的查尔斯·泽维尔。突然有一天，一位陌生女子让罗根去载一个叫劳拉·金尼的女孩去加拿大边境，一开始罗根拒绝了，但查尔斯·泽维尔一直在等着这个女孩的出现，因为劳拉·金尼拥有超强的战斗力，而且在许多方面都很像金刚狼。她被一个强大公司的幕后人物所追踪，因为她的DNA里有着连接罗根的秘密，由此一场无休止的追捕开始。